Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms