Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRMS1Q9HCU9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRMS1Q9HCU9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms