Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UPF2Q9HAU5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPF2Q9HAU5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms