Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUDS3Q9H7L9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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