Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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