Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GANQ9H2C0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GANQ9H2C0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms