Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCBP2Q9H190 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms