Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC8Q9H0W5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms