Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM39BQ9GZU3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39BQ9GZU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms