Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK3Q9BYB0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK3Q9BYB0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK3Q9BYB0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHANK3Q9BYB0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHANK3Q9BYB0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHANK3Q9BYB0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms