Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A5Q9BY07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms