Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD1Q9BXT4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD1Q9BXT4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD1Q9BXT4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD1Q9BXT4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD1Q9BXT4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD1Q9BXT4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRD1Q9BXT4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms