Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11FIP5Q9BXF6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms