Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BBS2Q9BXC9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms