Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM14BQ9BX40 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM14BQ9BX40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms