Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP58Q9BVL2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP58Q9BVL2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms