Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCMBPQ9BTE3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms