Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRACR2AQ9BSW2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRACR2AQ9BSW2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms