Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms