Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms