Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms