Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms