Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VGLL1Q99990 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms