Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP9Q99956 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms