Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms