Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCT8L2Q96SF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCT8L2Q96SF2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms