Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms