Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBGCP5Q96RT8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBGCP5Q96RT8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms