Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF13CQ96RJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms