Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX18Q96RF0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms