Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms