Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMG1Q96Q15 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMG1Q96Q15 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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