Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms