Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms