Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JSRP1Q96MG2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
JSRP1Q96MG2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms