Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms