Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms