Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CMTM5Q96DZ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMTM5Q96DZ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMTM5Q96DZ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMTM5Q96DZ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms