Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF428Q96B54 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF428Q96B54 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms