Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms