Protein–RNA interactions for Protein: Q92900

UPF1, Regulator of nonsense transcripts 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF1Q92900 MFSD12-204ENST00000585788 1769 nt26■■□□□ 1.751e-9■■■■■ 27.9
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UPF1Q92900 ELOVL1-205ENST00000468865 797 ntTSL 315.87■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 27.9
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UPF1Q92900 AC008870.1-201ENST00000566996 3009 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 27.9
UPF1Q92900 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 27.9
UPF1Q92900 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 27.9
UPF1Q92900 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.811e-22■■■■■ 27.9
UPF1Q92900 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-22■■■■■ 27.9
UPF1Q92900 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.15e-9■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 P4HB-210ENST00000476482 765 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.264e-50■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 POFUT2-205ENST00000460932 616 ntTSL 223.09■■□□□ 1.299e-8■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 POFUT2-210ENST00000485190 616 ntTSL 215.07■□□□□ 04e-8■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.847e-30■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 KIDINS220-210ENST00000496383 3220 ntTSL 59.11□□□□□ -0.956e-9■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.156e-9■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.246e-9■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 55.95□□□□□ -1.466e-9■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 C11orf58-204ENST00000524508 406 ntTSL 513.97□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.591e-15■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.882e-8■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.836e-9■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 SUPT4H1-205ENST00000581166 1401 ntTSL 219.88■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 27.8
UPF1Q92900 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 27.8
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