Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF1Q92879 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF1Q92879 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms