Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDAQ92838 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDAQ92838 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDAQ92838 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms