Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDEM1Q92611 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms