Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CTTNBP2Q8WZ74 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CTTNBP2Q8WZ74 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms