Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF31Q8WWY3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF31Q8WWY3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms