Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF398Q8TD17 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF398Q8TD17 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms