Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF397Q8NF99 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF397Q8NF99 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms