Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBOF1Q8ND07 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBOF1Q8ND07 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms