Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATAD1Q8NBU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD1Q8NBU5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms